Ban Quản lý dự án Đầu tư xây dựng công trình Giao thông và Nông nghiệp phía Bắc (sau đây viết tắt là Ban QLDA ĐTXD phía Bắc) được thành lập trên cơ sở hợp nhất Ban Quản lý dự án đầu tư xây dựng công trình giao thông tỉnh Bắc Kạn và Ban QLDA đầu tư xây dựng công trình Nông nghiệp và PTNT tỉnh Bắc Kạn.